Der Vorstand und der Beirat bilden die Organe der Ernst-Abbe-Stiftung.
Stiftungsvorstand
Christoph Matschie (Vorsitz)
Dr. Stefan Danz
Justus Wehmer
Stiftungsbeirat
Dr. Felix Streiter (Vorsitz)
Prof. Dr. Georg Pohnert
Prof. Dr. Elmar Heinemann
Dr. Birgit Klaubert
Geschäftsführung
Jörg Hühn (Stellvertretender Geschäftsführer)